Na břehu Otavy stojí panský dům, který parta kluků považuje za velmi tajemný. Po jeho návštěvě kluci zjistí, že tu není nic jiného než stará paní se svou vnučkou. Parta se rozdělí na dva tábory a nastanou líté boje, které ale nemají dlouhého trvání.
'Kluci na řece' je často srovnáván s jinými dětskými filmy té doby, jako je například 'Cesta do pravěku' od Karla Zemana, i když se jedná o odlišné žánry.
'Kluci na řece' je považován za jeden z prvních českých filmů, který se zaměřuje na dětské hrdiny a jejich dobrodružství.
Film 'Kluci na řece' byl natočen během druhé světové války v roce 1944, což ovlivnilo jeho produkční podmínky.