Před třiatřiceti lety se na Zemi přes dimenzionální portál nad Antarktidou dostala mimozemská síla známá jako „JAM“. Pozemské síly dokázaly JAM vytlačit na vzdálenou planetu pojmenovanou „Fairy“. Zatímco většina obyvatel Země o existenci JAM neví, válka na planetě Fairy stále pokračuje. Rei Fukai je pilotem SAF (Speciálních vzdušných sil) a má za úkol ovládat „Yukikaze“ – pokročilý průzkumný stíhací letoun vybavený téměř vědomou umělou inteligencí, která dokáže detekovat přítomnost JAM v jeho blízkosti.